Esta etapa 3, definición raíz de sistemas relevantes, es el proceso de formalizar las hipótesis sobre los sistemas de actividad humana, esto es, aquellos que ayudan al desarrollo del modelo de sistema de actividades, implicado en la situación del problema. Puede haber varias definiciones raíz, cada una contendrá suposiciones y un punto de vista determinado, cada una afirmará diversas partes de la visión enriquecida. Para crear las definiciones raíz, hay algunos elementos esenciales que necesitan ser incluidos, esto se resume a través de la palabra nemotécnica CATWOE, como sigue:

Clientes, son los beneficiarios o víctimas afectados por las actividades del sistema. Pueden ser internos o externos al sistema. Estos podrían ser algunos tipos de clientes: académico, estudiante, médico, y mezclas de ellos.

Agentes son los actores del cambio. Realizan las actividades del sistema

Transformación es aquel proceso o tarea que describe el trabajo real realizado por el sistema. Debe ser singular y lógicamente coherente.

Weltanschauung son las suposiciones en las cuales descansa la perspectiva para hacer las definiciones raíz significativas. Se realiza esta actividad porque, en primer lugar, las ideas, los conceptos y los métodos que forman la SSM son inestimables para el cliente, y en segundo lugar, la estructura recientemente disponible de la presentación es inadecuada para el cliente referido.

Owner o propietario es el responsable, es quién se reserva los derechos de parar la actividad entera.

Enviroment o ambiente en el cual la actividad del sistema se efectúa.

La estructura del CATWOE implica que la versión más simple de una definición raíz sería "un sistema para hacer X" donde X es un proceso de transformación particular. Esto lleva al sistema mismo a seleccionar un medio de hacer X, entre varios disponibles; el sistema podría elegir un "como" para el "que" definido por X. Esto podría integrar ya una regla para construir una definición raíz: un sistema para hacer X mediante Y y así lograr Z, donde Y serían los medios adecuados y Z estaría relacionada con los objetivos a largo plazo.

Es necesario prestar atención a la formulación del nombramiento de los sistemas relevantes para escribirlos de manera que, posteriormente, un modelo conceptual pueda ser construido basado en cada nombramiento. Estos nombramientos se conocen como definiciones raíz. El propósito de la definición raíz es expresar el propósito central de un cierto sistema útil de actividad. Es importante que se ponga atención en el desarrollo de las definiciones raíz.  Las definiciones raíz correctamente escritas proveen una directriz mucho más simple de usar en la construcción del modelo conceptual de un sistema.

Una definición de raíz se expresa como un proceso de transformación que toma una entidad como entrada de información, cambia o transforma a esa entidad, y produce una nueva forma de la entidad. Una prescripción para desarrollar estos procesos la transformación se muestra en la siguiente tabla, que muestra ejemplos de transformaciones típicas de la operación de un curso de golf. Como usted puede notar, estas transformaciones variarán grandemente, dependiendo de la opinión del mundo que se aplique.

Tabla 1. Transformaciones una a una que implican opiniones diferentes del mundo.

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